Esta etapa consta de cuatro cursos obligatorios una vez elegida la serie de especialización. Tres de ellos corresponden al área específica de interés del doctorante, y el cuarto curso debe ser elegido de entre los cursos pertenecientes al ciclo de especialización de las otras áreas; su objeto es ampliar el espectro de posibilidades de complementación. Las áreas de especialización del doctorado y sus correspondientes cursos se enuncian a continuación:
| AREA TRANSPORTE |
AREA GESTION DE OPERACIONES |
AREA DE ENERGIA |
AREA ECONOMIA |
| Redes de Transporte y Circulación |
Logística y Producción |
Análisis de Operación de Sistemas Eléctricos |
Teoría de Juegos y Teoría de Contratos |
| Demanda de Transporte |
Tecnología de Información y Rediseño de Procesos |
Fenómenos Dinámicos en Redes Eléctricas |
Macroeconomía |
| Economía de Transporte y Localización |
Gestión de Operaciones en la Industria de Servicios |
Mercados Energéticos Internacionales |
Econometría Métodos de Economía Dinámica |
| Un curso del área de gestión de operaciones, energía o economía |
Un curso del área de transporte, energía o economía |
Un curso del área de transporte, gestión de operaciones o economía |
Un curso del área de transporte, gestión de operaciones o energía. |